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大分子轨迹可视化(Visualization of Large Molecular Trajectories)

分子动力学模拟是对原子和分子的物理运动及其相互运动的计算机模拟。这些模拟可以应用于化学物理、材料科学和生物分子建模等多个领域。在药理学、药物设计和酶催化领域,分子动力学模拟可以预测小分子药物(配体)与生物分子(蛋白质)的结合模式及结合亲和力。本工作对配体与受体蛋白结合的过程中的数据及其轨迹进行可视化,处理的数据为三个配体同时与受体蛋白结合的过程,整个过程持续时间多于80万个时间步。

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IGAL可视化讲习班-9:全细胞可视化与建模 – Ivan Viola

12月28日上午,来自阿卜杜拉国王科技大学的Ivan Viola教授为大家带来了题为《全细胞可视化与建模》的讲座。Ivan Viola教授首先通过一个对HIV血浆的可视化的案例让大家对于生物医学可视化有一个整体的理解。对生物医疗数据的可视化的主要动因是其可以有效地帮助用户理解、探索生物医学数据,但仍然存在许多挑战。如其拥有复杂的几何构型,个体数量十分庞大,且在多尺度之间迁移十分困难。对于全细胞的可视化的任务被定义为通过计算机图形学和可视化的技术来描绘多尺度的生命形式。

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