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连接性浏览器:基于大容量神经科学体数据查询的可视分析 (Connectome Explorer: Query-Guided Visual Analysis of Large Volumetric Neuroscience Data)

在神经科学中,神经元之间的连接性可视化一直是一个热门的研究课题,现有的方法大部分只提供二维神经元连接性的可视分析,缺乏直观的三维体绘制效果。本文[1]可视化的数据中包括以下几个神经元研究对象:Synapse(神经元的突触),Axons(轴突),Dendrite(树突),Glia(神经胶质).

本文[1]仿照SQL语言中查询机制,对大容量神经科学体数据进行查询与分析。如图2所示,具体步骤包括

1) 数据采集;数据采集自电子显微镜,体绘制数据包括多个体数据,EM Data体数据,Segmentation体数据,其中Segmentation体数据是由人工结合一些智能识别算法Trace出来的。也就是说,神经元数据之间的连接性由人工手动tracing得到的。

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